在教会历史的大部分时期，执行教会纪律都是教会的正常事务。为何要执行教会纪律？
一、为了被管教之人的益处。那位哥林多男子在自己的罪中沉沦，以为神允许他与自己的继母乱伦，林前5:1–5。加拉太教会的信徒认为，他们可以依靠自己的行为，而不是单单信靠基督，加6:1–5。亚历山大和许米乃以为可以亵渎神，提前1:20。但是这些人没有一个能在神面前站立得住。出于对这些人的爱，我们希望教会施行惩戒。我们不希望教会容忍那些刚硬的、顽固的伪君子在他们的罪中沉睡。我们不希望个人如此生活，也不希望教会如此生活。
二、为了其他信徒的益处，让他们看到罪的危险。保罗告诉提摩太，如果一位领袖犯罪，应该在众人面前责备他，提前5:20。这意思不是说，我作为牧师在任何时候只要犯了错，教会成员就应该在公共敬拜时站起来说，“嘿，牧师，那不对”。而是说，当一个信徒犯了严重的罪（尤其是不悔改的罪），教会需要在众人面前指出来，让其他人也看到罪的严重，向他们敲响警钟。
三、为了教会整个身体的健康。保罗恳求哥林多信徒，不应该因为容忍罪而自夸，林前5:6–8。他反问道：“岂不知一点面酵能使全团发起来吗？”酵代表了罪不洁和蔓延的特性。因此，保罗说：你们既是无酵的面，应当把旧酵除净，好使你们成为新团；因为我们逾越节的羔羊基督，已经被杀献祭了。所以，我们守这节不可用旧酵，也不可用恶毒、邪恶的酵，只用诚实真正的无酵饼。教会纪律不是教会的焦点，正如药物不是生命的中心。也许有些时候，你需要执行教会纪律，但总体而言，教会纪律不过是辅助你达成主要任务的方式。
四、为了教会的共同见证。教会纪律是传福音的有力工具。当我们的生活与众不同时，尤其是一个群体的生活与周遭的人不同时，人们会有所察觉。这种不同不是指一种完美的生活，而是指这群人带着明显的标志，诚实地爱神且彼此相爱。如果人们看到教会随从世界而生活，我们福音工作的开展就会变得更加困难。如果我们看起来和非信徒没有什么分别，他们也就不会有什么问题想问我们。希望周围的人能对我们的生活始终充满好奇，太5:16；约13:34–35。
五、为了神的荣耀，因为我们会返照神的圣洁。圣经清楚指出，神是为了自己的荣耀创造我们，弗5:25–27。执行教会纪律最有说服力的理由就是荣耀神。我们正是为此而活！人类受造就是为了展现神的形象，创1:27。因此也就不奇怪，在整个旧约圣经中，当神要塑造一群彰显祂形象的百姓时，指示他们要圣洁，因为唯有如此，他们的性情才更像神自己，利19:2。在旧约时代，神要为自己造就一群百姓时，圣洁是矫正他们，甚至是将他们逐出的依据；圣洁也是新约教会形成的基础，林后6:14–7:1。圣洁应当成为基督徒明显的特质，不是为了我们自己的名声，而是为了神的荣耀。我们是世上的光，众人看见我们的好行为，便会将荣耀归给神，太5:16。
长期以来一直公认教会纪律是对教会成员身份的一个界定。其前提是，教会成员是一群按理领受圣餐，没有羞辱教会，省察自己的行为，没有使神和他的福音蒙羞之人，林前11章。只有教会可以执行且必须执行教会纪律。合乎圣经的教会纪律就是单单顺服神，单单承认我们需要帮助。我们无法独自过基督徒生活。我们执行教会纪律的目的是正面积极的，是为了被管教之人的益处；是为了其他信徒的益处，让他们看到罪的危险；是为了教会整个身体的健康；是为了教会在世人面前的共同见证。最重要的是，我们的圣洁能够彰显出神的圣洁。我们应当严肃看待教会成员身份，不是为了我们的骄傲，而是为了神的名。合乎圣经的教会纪律是健康教会的一个标志。